Існують різні пристрої для синтезу бібліотеки пептидів, такі як повністю автоматичний синтезатор бібліотеки пептидів Apex 396HT. Ці пристрої можуть автоматично готувати та розрізати бібліотеки пептидів, тим самим підвищуючи ефективність синтезу та вихід.